Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms