Protein–RNA interactions for Protein: Q8K296

Mtmr3, Myotubularin-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr3Q8K296 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mtmr3Q8K296 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mtmr3Q8K296 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mtmr3Q8K296 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mtmr3Q8K296 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Mtmr3Q8K296 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mtmr3Q8K296 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mtmr3Q8K296 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mtmr3Q8K296 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mtmr3Q8K296 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mtmr3Q8K296 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mtmr3Q8K296 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mtmr3Q8K296 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mtmr3Q8K296 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mtmr3Q8K296 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mtmr3Q8K296 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mtmr3Q8K296 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mtmr3Q8K296 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mtmr3Q8K296 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mtmr3Q8K296 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mtmr3Q8K296 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mtmr3Q8K296 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mtmr3Q8K296 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mtmr3Q8K296 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mtmr3Q8K296 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mtmr3Q8K296 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Mtmr3Q8K296 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Mtmr3Q8K296 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mtmr3Q8K296 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mtmr3Q8K296 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mtmr3Q8K296 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mtmr3Q8K296 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Mtmr3Q8K296 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mtmr3Q8K296 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mtmr3Q8K296 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mtmr3Q8K296 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mtmr3Q8K296 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mtmr3Q8K296 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mtmr3Q8K296 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mtmr3Q8K296 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mtmr3Q8K296 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mtmr3Q8K296 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mtmr3Q8K296 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mtmr3Q8K296 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mtmr3Q8K296 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mtmr3Q8K296 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mtmr3Q8K296 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mtmr3Q8K296 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mtmr3Q8K296 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mtmr3Q8K296 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mtmr3Q8K296 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Mtmr3Q8K296 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Mtmr3Q8K296 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Mtmr3Q8K296 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mtmr3Q8K296 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mtmr3Q8K296 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mtmr3Q8K296 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mtmr3Q8K296 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mtmr3Q8K296 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mtmr3Q8K296 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mtmr3Q8K296 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mtmr3Q8K296 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mtmr3Q8K296 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mtmr3Q8K296 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mtmr3Q8K296 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mtmr3Q8K296 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mtmr3Q8K296 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Mtmr3Q8K296 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mtmr3Q8K296 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mtmr3Q8K296 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mtmr3Q8K296 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Mtmr3Q8K296 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mtmr3Q8K296 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mtmr3Q8K296 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mtmr3Q8K296 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mtmr3Q8K296 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mtmr3Q8K296 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mtmr3Q8K296 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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