Protein–RNA interactions for Protein: Q8K202

Polr1e, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1eQ8K202 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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