Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Nhlrc3Q8CCH2 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Nhlrc3Q8CCH2 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Nhlrc3Q8CCH2 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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