Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ssuh2Q8C3L1 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ssuh2Q8C3L1 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ssuh2Q8C3L1 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ssuh2Q8C3L1 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ssuh2Q8C3L1 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ssuh2Q8C3L1 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ssuh2Q8C3L1 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ssuh2Q8C3L1 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ssuh2Q8C3L1 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ssuh2Q8C3L1 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ssuh2Q8C3L1 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ssuh2Q8C3L1 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ssuh2Q8C3L1 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ssuh2Q8C3L1 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ssuh2Q8C3L1 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ssuh2Q8C3L1 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ssuh2Q8C3L1 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ssuh2Q8C3L1 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ssuh2Q8C3L1 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ssuh2Q8C3L1 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ssuh2Q8C3L1 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ssuh2Q8C3L1 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ssuh2Q8C3L1 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssuh2Q8C3L1 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssuh2Q8C3L1 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssuh2Q8C3L1 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssuh2Q8C3L1 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssuh2Q8C3L1 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssuh2Q8C3L1 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssuh2Q8C3L1 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssuh2Q8C3L1 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssuh2Q8C3L1 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssuh2Q8C3L1 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssuh2Q8C3L1 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssuh2Q8C3L1 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssuh2Q8C3L1 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssuh2Q8C3L1 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssuh2Q8C3L1 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssuh2Q8C3L1 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssuh2Q8C3L1 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssuh2Q8C3L1 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssuh2Q8C3L1 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssuh2Q8C3L1 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssuh2Q8C3L1 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssuh2Q8C3L1 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssuh2Q8C3L1 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssuh2Q8C3L1 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssuh2Q8C3L1 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssuh2Q8C3L1 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssuh2Q8C3L1 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssuh2Q8C3L1 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssuh2Q8C3L1 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssuh2Q8C3L1 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssuh2Q8C3L1 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssuh2Q8C3L1 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssuh2Q8C3L1 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssuh2Q8C3L1 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssuh2Q8C3L1 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssuh2Q8C3L1 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssuh2Q8C3L1 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssuh2Q8C3L1 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssuh2Q8C3L1 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssuh2Q8C3L1 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssuh2Q8C3L1 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssuh2Q8C3L1 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssuh2Q8C3L1 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssuh2Q8C3L1 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssuh2Q8C3L1 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssuh2Q8C3L1 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssuh2Q8C3L1 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssuh2Q8C3L1 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssuh2Q8C3L1 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssuh2Q8C3L1 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssuh2Q8C3L1 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssuh2Q8C3L1 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssuh2Q8C3L1 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssuh2Q8C3L1 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssuh2Q8C3L1 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssuh2Q8C3L1 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssuh2Q8C3L1 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssuh2Q8C3L1 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssuh2Q8C3L1 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssuh2Q8C3L1 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssuh2Q8C3L1 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssuh2Q8C3L1 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssuh2Q8C3L1 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssuh2Q8C3L1 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssuh2Q8C3L1 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssuh2Q8C3L1 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssuh2Q8C3L1 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssuh2Q8C3L1 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssuh2Q8C3L1 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssuh2Q8C3L1 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssuh2Q8C3L1 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssuh2Q8C3L1 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssuh2Q8C3L1 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssuh2Q8C3L1 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssuh2Q8C3L1 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssuh2Q8C3L1 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms