Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Atg16l1Q8C0J2 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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