Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Gm14848-201ENSMUST00000121850 467 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Prl2c5-204ENSMUST00000151144 623 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Gm37543-201ENSMUST00000192443 1031 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Ighv8-1-201ENSMUST00000194897 291 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Gm18985-201ENSMUST00000196472 1079 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 4633401B06Rik-201ENSMUST00000198169 1073 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Lrp1b-212ENSMUST00000204204 798 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 AC138027.1-201ENSMUST00000218324 472 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 AC164629.1-201ENSMUST00000220250 1113 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 AC154219.1-201ENSMUST00000220764 1262 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 3830406C13Rik-203ENSMUST00000223631 1014 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Gm12940-202ENSMUST00000137236 1970 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 4933411E06Rik-201ENSMUST00000186016 1493 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 1700034E13Rik-202ENSMUST00000118724 490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Sycp3-203ENSMUST00000125612 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 2310010J17Rik-201ENSMUST00000181189 490 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Gm28129-201ENSMUST00000186273 537 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Trim35Q8C006 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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