Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Pggt1bQ8BUY9 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Pggt1bQ8BUY9 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Pggt1bQ8BUY9 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Pggt1bQ8BUY9 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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