Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP99

UPF0500 protein C1orf216 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BP99 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q8BP99 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Q8BP99 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q8BP99 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Q8BP99 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Q8BP99 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Q8BP99 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q8BP99 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q8BP99 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q8BP99 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q8BP99 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q8BP99 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q8BP99 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q8BP99 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q8BP99 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q8BP99 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q8BP99 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q8BP99 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q8BP99 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q8BP99 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q8BP99 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8BP99 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8BP99 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8BP99 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8BP99 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8BP99 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8BP99 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8BP99 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8BP99 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8BP99 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8BP99 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8BP99 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8BP99 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8BP99 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8BP99 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8BP99 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8BP99 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8BP99 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8BP99 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8BP99 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8BP99 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8BP99 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8BP99 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8BP99 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8BP99 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8BP99 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8BP99 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8BP99 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8BP99 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8BP99 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8BP99 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8BP99 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8BP99 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8BP99 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8BP99 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q8BP99 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8BP99 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8BP99 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8BP99 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8BP99 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8BP99 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8BP99 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8BP99 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8BP99 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8BP99 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8BP99 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8BP99 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8BP99 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8BP99 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8BP99 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8BP99 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8BP99 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8BP99 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8BP99 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8BP99 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8BP99 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8BP99 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8BP99 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8BP99 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8BP99 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8BP99 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8BP99 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8BP99 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8BP99 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8BP99 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8BP99 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8BP99 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8BP99 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8BP99 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8BP99 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8BP99 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8BP99 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8BP99 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8BP99 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8BP99 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8BP99 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8BP99 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8BP99 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8BP99 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q8BP99 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms