Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

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Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Ubash3bQ8BGG7 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Ubash3bQ8BGG7 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Ubash3bQ8BGG7 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Ubash3bQ8BGG7 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Ubash3bQ8BGG7 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Ubash3bQ8BGG7 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Ubash3bQ8BGG7 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Ubash3bQ8BGG7 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms