Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFS6

Cpped1, Serine/threonine-protein phosphatase CPPED1, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpped1Q8BFS6 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cpped1Q8BFS6 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cpped1Q8BFS6 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cpped1Q8BFS6 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cpped1Q8BFS6 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cpped1Q8BFS6 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cpped1Q8BFS6 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cpped1Q8BFS6 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cpped1Q8BFS6 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cpped1Q8BFS6 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cpped1Q8BFS6 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cpped1Q8BFS6 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cpped1Q8BFS6 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cpped1Q8BFS6 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cpped1Q8BFS6 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cpped1Q8BFS6 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cpped1Q8BFS6 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cpped1Q8BFS6 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cpped1Q8BFS6 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cpped1Q8BFS6 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cpped1Q8BFS6 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cpped1Q8BFS6 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cpped1Q8BFS6 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cpped1Q8BFS6 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cpped1Q8BFS6 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cpped1Q8BFS6 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cpped1Q8BFS6 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cpped1Q8BFS6 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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