Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms