Protein–RNA interactions for Protein: Q640N4

Zfp248, Zinc finger protein 248, mousemouse

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Length 576 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp248Q640N4 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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Zfp248Q640N4 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
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Zfp248Q640N4 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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Zfp248Q640N4 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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Zfp248Q640N4 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
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Zfp248Q640N4 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Zfp248Q640N4 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
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