Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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