Protein–RNA interactions for Protein: Q5UBV8

Tnfsf15, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 15, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf15Q5UBV8 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tnfsf15Q5UBV8 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tnfsf15Q5UBV8 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tnfsf15Q5UBV8 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tnfsf15Q5UBV8 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tnfsf15Q5UBV8 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tnfsf15Q5UBV8 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Tnfsf15Q5UBV8 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Tnfsf15Q5UBV8 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tnfsf15Q5UBV8 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tnfsf15Q5UBV8 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tnfsf15Q5UBV8 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tnfsf15Q5UBV8 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tnfsf15Q5UBV8 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tnfsf15Q5UBV8 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tnfsf15Q5UBV8 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tnfsf15Q5UBV8 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsf15Q5UBV8 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsf15Q5UBV8 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsf15Q5UBV8 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tnfsf15Q5UBV8 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tnfsf15Q5UBV8 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.3 ms