Protein–RNA interactions for Protein: Q58FA4

E2f8, Transcription factor E2F8, mousemouse

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f8Q58FA4 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
E2f8Q58FA4 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
E2f8Q58FA4 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2f8Q58FA4 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2f8Q58FA4 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2f8Q58FA4 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
E2f8Q58FA4 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
E2f8Q58FA4 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
E2f8Q58FA4 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
E2f8Q58FA4 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
E2f8Q58FA4 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
E2f8Q58FA4 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
E2f8Q58FA4 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
E2f8Q58FA4 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
E2f8Q58FA4 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
E2f8Q58FA4 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
E2f8Q58FA4 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
E2f8Q58FA4 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
E2f8Q58FA4 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
E2f8Q58FA4 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
E2f8Q58FA4 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
E2f8Q58FA4 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
E2f8Q58FA4 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E2f8Q58FA4 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E2f8Q58FA4 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.05■□□□□ -0
E2f8Q58FA4 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E2f8Q58FA4 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.05■□□□□ -0
E2f8Q58FA4 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.05■□□□□ -0
E2f8Q58FA4 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
E2f8Q58FA4 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
E2f8Q58FA4 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
E2f8Q58FA4 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.05■□□□□ -0
E2f8Q58FA4 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E2f8Q58FA4 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E2f8Q58FA4 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E2f8Q58FA4 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E2f8Q58FA4 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.05■□□□□ -0
E2f8Q58FA4 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E2f8Q58FA4 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E2f8Q58FA4 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E2f8Q58FA4 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E2f8Q58FA4 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E2f8Q58FA4 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E2f8Q58FA4 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E2f8Q58FA4 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.05■□□□□ -0
E2f8Q58FA4 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E2f8Q58FA4 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
E2f8Q58FA4 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
E2f8Q58FA4 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2f8Q58FA4 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2f8Q58FA4 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2f8Q58FA4 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2f8Q58FA4 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2f8Q58FA4 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2f8Q58FA4 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
E2f8Q58FA4 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.04■□□□□ -0
E2f8Q58FA4 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2f8Q58FA4 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2f8Q58FA4 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2f8Q58FA4 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2f8Q58FA4 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2f8Q58FA4 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
E2f8Q58FA4 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2f8Q58FA4 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
E2f8Q58FA4 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
E2f8Q58FA4 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2f8Q58FA4 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2f8Q58FA4 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2f8Q58FA4 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.04■□□□□ -0
E2f8Q58FA4 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2f8Q58FA4 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
E2f8Q58FA4 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2f8Q58FA4 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
E2f8Q58FA4 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2f8Q58FA4 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2f8Q58FA4 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2f8Q58FA4 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2f8Q58FA4 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
E2f8Q58FA4 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2f8Q58FA4 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
E2f8Q58FA4 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2f8Q58FA4 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2f8Q58FA4 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2f8Q58FA4 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2f8Q58FA4 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2f8Q58FA4 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2f8Q58FA4 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2f8Q58FA4 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2f8Q58FA4 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2f8Q58FA4 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
E2f8Q58FA4 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.03■□□□□ -0
E2f8Q58FA4 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2f8Q58FA4 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
E2f8Q58FA4 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
E2f8Q58FA4 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2f8Q58FA4 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.03■□□□□ -0
E2f8Q58FA4 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2f8Q58FA4 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
E2f8Q58FA4 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
E2f8Q58FA4 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms