Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3V9

Carmil2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil2Q3V3V9 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Carmil2Q3V3V9 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms