Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0S6

Rasip1, Ras-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasip1Q3U0S6 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rasip1Q3U0S6 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rasip1Q3U0S6 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rasip1Q3U0S6 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rasip1Q3U0S6 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rasip1Q3U0S6 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rasip1Q3U0S6 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rasip1Q3U0S6 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rasip1Q3U0S6 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rasip1Q3U0S6 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rasip1Q3U0S6 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rasip1Q3U0S6 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rasip1Q3U0S6 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rasip1Q3U0S6 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rasip1Q3U0S6 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rasip1Q3U0S6 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rasip1Q3U0S6 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rasip1Q3U0S6 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rasip1Q3U0S6 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rasip1Q3U0S6 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rasip1Q3U0S6 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rasip1Q3U0S6 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rasip1Q3U0S6 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rasip1Q3U0S6 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rasip1Q3U0S6 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rasip1Q3U0S6 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rasip1Q3U0S6 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rasip1Q3U0S6 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rasip1Q3U0S6 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rasip1Q3U0S6 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rasip1Q3U0S6 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rasip1Q3U0S6 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rasip1Q3U0S6 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rasip1Q3U0S6 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rasip1Q3U0S6 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rasip1Q3U0S6 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rasip1Q3U0S6 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rasip1Q3U0S6 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rasip1Q3U0S6 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rasip1Q3U0S6 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rasip1Q3U0S6 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rasip1Q3U0S6 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rasip1Q3U0S6 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rasip1Q3U0S6 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rasip1Q3U0S6 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rasip1Q3U0S6 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rasip1Q3U0S6 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rasip1Q3U0S6 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rasip1Q3U0S6 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rasip1Q3U0S6 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rasip1Q3U0S6 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rasip1Q3U0S6 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rasip1Q3U0S6 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rasip1Q3U0S6 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rasip1Q3U0S6 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rasip1Q3U0S6 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rasip1Q3U0S6 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rasip1Q3U0S6 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rasip1Q3U0S6 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rasip1Q3U0S6 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rasip1Q3U0S6 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rasip1Q3U0S6 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rasip1Q3U0S6 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rasip1Q3U0S6 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rasip1Q3U0S6 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rasip1Q3U0S6 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rasip1Q3U0S6 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rasip1Q3U0S6 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rasip1Q3U0S6 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rasip1Q3U0S6 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rasip1Q3U0S6 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rasip1Q3U0S6 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rasip1Q3U0S6 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rasip1Q3U0S6 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rasip1Q3U0S6 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rasip1Q3U0S6 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rasip1Q3U0S6 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rasip1Q3U0S6 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rasip1Q3U0S6 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rasip1Q3U0S6 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rasip1Q3U0S6 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rasip1Q3U0S6 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rasip1Q3U0S6 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rasip1Q3U0S6 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rasip1Q3U0S6 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rasip1Q3U0S6 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rasip1Q3U0S6 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rasip1Q3U0S6 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rasip1Q3U0S6 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rasip1Q3U0S6 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rasip1Q3U0S6 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rasip1Q3U0S6 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rasip1Q3U0S6 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rasip1Q3U0S6 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rasip1Q3U0S6 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rasip1Q3U0S6 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rasip1Q3U0S6 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rasip1Q3U0S6 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rasip1Q3U0S6 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rasip1Q3U0S6 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms