Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf3c3Q3TMP1 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf3c3Q3TMP1 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf3c3Q3TMP1 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf3c3Q3TMP1 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf3c3Q3TMP1 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf3c3Q3TMP1 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf3c3Q3TMP1 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf3c3Q3TMP1 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf3c3Q3TMP1 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtf3c3Q3TMP1 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms