Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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ptchd1Q14B62 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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ptchd1Q14B62 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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ptchd1Q14B62 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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ptchd1Q14B62 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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ptchd1Q14B62 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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ptchd1Q14B62 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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ptchd1Q14B62 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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ptchd1Q14B62 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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ptchd1Q14B62 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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ptchd1Q14B62 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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ptchd1Q14B62 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ptchd1Q14B62 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
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ptchd1Q14B62 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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ptchd1Q14B62 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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ptchd1Q14B62 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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ptchd1Q14B62 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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