Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T7

Cntnap5c, Contactin-associated protein like 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5cQ0V8T7 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap5cQ0V8T7 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms