Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Vps8Q0P5W1 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms