Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
NrepQ07475 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
NrepQ07475 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC9.38□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC9.38□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
NrepQ07475 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
NrepQ07475 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
NrepQ07475 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC9.36□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
NrepQ07475 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
NrepQ07475 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
NrepQ07475 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms