Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

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Length 2,841 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Nf1Q04690 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Nf1Q04690 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Nf1Q04690 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Nf1Q04690 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Nf1Q04690 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Nf1Q04690 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Nf1Q04690 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
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Nf1Q04690 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Nf1Q04690 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nf1Q04690 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Nf1Q04690 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nf1Q04690 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nf1Q04690 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nf1Q04690 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
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Nf1Q04690 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nf1Q04690 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nf1Q04690 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nf1Q04690 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nf1Q04690 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nf1Q04690 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nf1Q04690 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nf1Q04690 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nf1Q04690 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
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Nf1Q04690 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nf1Q04690 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nf1Q04690 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
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Nf1Q04690 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nf1Q04690 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nf1Q04690 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
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Nf1Q04690 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nf1Q04690 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nf1Q04690 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nf1Q04690 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
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Nf1Q04690 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nf1Q04690 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
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Nf1Q04690 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nf1Q04690 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
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Nf1Q04690 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
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Nf1Q04690 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nf1Q04690 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Nf1Q04690 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nf1Q04690 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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Nf1Q04690 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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Nf1Q04690 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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Nf1Q04690 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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Nf1Q04690 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nf1Q04690 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nf1Q04690 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nf1Q04690 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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Nf1Q04690 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
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Nf1Q04690 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nf1Q04690 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nf1Q04690 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nf1Q04690 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nf1Q04690 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nf1Q04690 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nf1Q04690 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nf1Q04690 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Nf1Q04690 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
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Nf1Q04690 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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