Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms