Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cacna1sQ02789 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cacna1sQ02789 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cacna1sQ02789 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cacna1sQ02789 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cacna1sQ02789 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cacna1sQ02789 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Cacna1sQ02789 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cacna1sQ02789 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cacna1sQ02789 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cacna1sQ02789 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cacna1sQ02789 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cacna1sQ02789 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cacna1sQ02789 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cacna1sQ02789 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cacna1sQ02789 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cacna1sQ02789 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cacna1sQ02789 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cacna1sQ02789 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cacna1sQ02789 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cacna1sQ02789 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Cacna1sQ02789 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cacna1sQ02789 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cacna1sQ02789 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cacna1sQ02789 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cacna1sQ02789 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Cacna1sQ02789 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cacna1sQ02789 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cacna1sQ02789 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cacna1sQ02789 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cacna1sQ02789 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cacna1sQ02789 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cacna1sQ02789 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cacna1sQ02789 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cacna1sQ02789 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cacna1sQ02789 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cacna1sQ02789 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Cacna1sQ02789 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Cacna1sQ02789 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cacna1sQ02789 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cacna1sQ02789 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cacna1sQ02789 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cacna1sQ02789 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cacna1sQ02789 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cacna1sQ02789 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cacna1sQ02789 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Cacna1sQ02789 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cacna1sQ02789 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Cacna1sQ02789 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cacna1sQ02789 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cacna1sQ02789 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cacna1sQ02789 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cacna1sQ02789 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cacna1sQ02789 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cacna1sQ02789 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cacna1sQ02789 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cacna1sQ02789 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cacna1sQ02789 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cacna1sQ02789 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cacna1sQ02789 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cacna1sQ02789 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cacna1sQ02789 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms