Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GscQ02591 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GscQ02591 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GscQ02591 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GscQ02591 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
GscQ02591 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GscQ02591 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GscQ02591 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GscQ02591 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GscQ02591 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GscQ02591 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GscQ02591 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GscQ02591 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GscQ02591 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GscQ02591 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GscQ02591 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GscQ02591 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GscQ02591 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GscQ02591 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GscQ02591 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GscQ02591 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GscQ02591 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GscQ02591 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
GscQ02591 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GscQ02591 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GscQ02591 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GscQ02591 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GscQ02591 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GscQ02591 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GscQ02591 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GscQ02591 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
GscQ02591 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GscQ02591 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GscQ02591 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GscQ02591 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GscQ02591 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GscQ02591 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GscQ02591 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GscQ02591 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GscQ02591 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GscQ02591 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GscQ02591 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GscQ02591 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GscQ02591 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GscQ02591 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GscQ02591 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GscQ02591 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GscQ02591 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GscQ02591 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GscQ02591 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GscQ02591 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GscQ02591 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GscQ02591 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GscQ02591 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GscQ02591 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GscQ02591 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GscQ02591 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GscQ02591 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GscQ02591 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GscQ02591 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GscQ02591 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
GscQ02591 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GscQ02591 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
GscQ02591 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GscQ02591 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GscQ02591 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
GscQ02591 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GscQ02591 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GscQ02591 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GscQ02591 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GscQ02591 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GscQ02591 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GscQ02591 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GscQ02591 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GscQ02591 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GscQ02591 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GscQ02591 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GscQ02591 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GscQ02591 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GscQ02591 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GscQ02591 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GscQ02591 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GscQ02591 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GscQ02591 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GscQ02591 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GscQ02591 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GscQ02591 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GscQ02591 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GscQ02591 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GscQ02591 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GscQ02591 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GscQ02591 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GscQ02591 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GscQ02591 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GscQ02591 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GscQ02591 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GscQ02591 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GscQ02591 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GscQ02591 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GscQ02591 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms