Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.8 ms