Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cbx1P83917 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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