Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irx3P81067 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irx3P81067 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irx3P81067 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irx3P81067 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irx3P81067 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Irx3P81067 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irx3P81067 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irx3P81067 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irx3P81067 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx3P81067 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx3P81067 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms