Protein–RNA interactions for Protein: P61407

Tdrd6, Tudor domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 2,134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd6P61407 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tdrd6P61407 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tdrd6P61407 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tdrd6P61407 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tdrd6P61407 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tdrd6P61407 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tdrd6P61407 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tdrd6P61407 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tdrd6P61407 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tdrd6P61407 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tdrd6P61407 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tdrd6P61407 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tdrd6P61407 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Tdrd6P61407 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Tdrd6P61407 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tdrd6P61407 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tdrd6P61407 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tdrd6P61407 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tdrd6P61407 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tdrd6P61407 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tdrd6P61407 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tdrd6P61407 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tdrd6P61407 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tdrd6P61407 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tdrd6P61407 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tdrd6P61407 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tdrd6P61407 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tdrd6P61407 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tdrd6P61407 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tdrd6P61407 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Tdrd6P61407 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tdrd6P61407 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Tdrd6P61407 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Tdrd6P61407 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tdrd6P61407 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tdrd6P61407 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tdrd6P61407 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tdrd6P61407 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tdrd6P61407 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tdrd6P61407 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tdrd6P61407 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tdrd6P61407 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tdrd6P61407 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tdrd6P61407 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tdrd6P61407 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tdrd6P61407 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tdrd6P61407 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tdrd6P61407 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tdrd6P61407 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tdrd6P61407 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tdrd6P61407 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tdrd6P61407 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tdrd6P61407 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tdrd6P61407 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tdrd6P61407 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tdrd6P61407 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tdrd6P61407 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tdrd6P61407 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Tdrd6P61407 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tdrd6P61407 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tdrd6P61407 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tdrd6P61407 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tdrd6P61407 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tdrd6P61407 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tdrd6P61407 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tdrd6P61407 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tdrd6P61407 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tdrd6P61407 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tdrd6P61407 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tdrd6P61407 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tdrd6P61407 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tdrd6P61407 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tdrd6P61407 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tdrd6P61407 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tdrd6P61407 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tdrd6P61407 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tdrd6P61407 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tdrd6P61407 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tdrd6P61407 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tdrd6P61407 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tdrd6P61407 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tdrd6P61407 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tdrd6P61407 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tdrd6P61407 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tdrd6P61407 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tdrd6P61407 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tdrd6P61407 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tdrd6P61407 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tdrd6P61407 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tdrd6P61407 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tdrd6P61407 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tdrd6P61407 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tdrd6P61407 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tdrd6P61407 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tdrd6P61407 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tdrd6P61407 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tdrd6P61407 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tdrd6P61407 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tdrd6P61407 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tdrd6P61407 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms