Protein–RNA interactions for Protein: P61028

Rab8b, Ras-related protein Rab-8B, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab8bP61028 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab8bP61028 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab8bP61028 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab8bP61028 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab8bP61028 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab8bP61028 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab8bP61028 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab8bP61028 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab8bP61028 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab8bP61028 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab8bP61028 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab8bP61028 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab8bP61028 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab8bP61028 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab8bP61028 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab8bP61028 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab8bP61028 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab8bP61028 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab8bP61028 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab8bP61028 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab8bP61028 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab8bP61028 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab8bP61028 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab8bP61028 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab8bP61028 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab8bP61028 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab8bP61028 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab8bP61028 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab8bP61028 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab8bP61028 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab8bP61028 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab8bP61028 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab8bP61028 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab8bP61028 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab8bP61028 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab8bP61028 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab8bP61028 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab8bP61028 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab8bP61028 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab8bP61028 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab8bP61028 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab8bP61028 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab8bP61028 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab8bP61028 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab8bP61028 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab8bP61028 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab8bP61028 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab8bP61028 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab8bP61028 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab8bP61028 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab8bP61028 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab8bP61028 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab8bP61028 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab8bP61028 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab8bP61028 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab8bP61028 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab8bP61028 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab8bP61028 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab8bP61028 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab8bP61028 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab8bP61028 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab8bP61028 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab8bP61028 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab8bP61028 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab8bP61028 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab8bP61028 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab8bP61028 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab8bP61028 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab8bP61028 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab8bP61028 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab8bP61028 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab8bP61028 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab8bP61028 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab8bP61028 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab8bP61028 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab8bP61028 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab8bP61028 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab8bP61028 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab8bP61028 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab8bP61028 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab8bP61028 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab8bP61028 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab8bP61028 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab8bP61028 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab8bP61028 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab8bP61028 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab8bP61028 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab8bP61028 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab8bP61028 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab8bP61028 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab8bP61028 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab8bP61028 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab8bP61028 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab8bP61028 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab8bP61028 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab8bP61028 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab8bP61028 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab8bP61028 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab8bP61028 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab8bP61028 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms