Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ppfia3P60469 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppfia3P60469 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms