Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tpm2P58774 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpm2P58774 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms