Protein–RNA interactions for Protein: P48985

Atoh1, Protein atonal homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh1P48985 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms