Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
VdrP48281 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VdrP48281 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VdrP48281 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
VdrP48281 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14□□□□□ -0.17
VdrP48281 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
VdrP48281 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC14□□□□□ -0.17
VdrP48281 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VdrP48281 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC14□□□□□ -0.17
VdrP48281 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VdrP48281 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VdrP48281 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VdrP48281 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VdrP48281 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VdrP48281 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VdrP48281 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VdrP48281 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
VdrP48281 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
VdrP48281 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VdrP48281 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
VdrP48281 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VdrP48281 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VdrP48281 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VdrP48281 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VdrP48281 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
VdrP48281 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VdrP48281 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
VdrP48281 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VdrP48281 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
VdrP48281 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VdrP48281 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VdrP48281 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
VdrP48281 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
VdrP48281 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VdrP48281 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
VdrP48281 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
VdrP48281 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
VdrP48281 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VdrP48281 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
VdrP48281 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
VdrP48281 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
VdrP48281 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
VdrP48281 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VdrP48281 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
VdrP48281 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VdrP48281 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VdrP48281 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
VdrP48281 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
VdrP48281 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VdrP48281 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VdrP48281 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VdrP48281 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VdrP48281 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VdrP48281 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VdrP48281 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VdrP48281 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VdrP48281 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VdrP48281 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VdrP48281 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
VdrP48281 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
VdrP48281 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
VdrP48281 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
VdrP48281 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
VdrP48281 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
VdrP48281 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
VdrP48281 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
VdrP48281 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
VdrP48281 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
VdrP48281 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
VdrP48281 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
VdrP48281 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
VdrP48281 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
VdrP48281 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
VdrP48281 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
VdrP48281 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
VdrP48281 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
VdrP48281 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
VdrP48281 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
VdrP48281 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
VdrP48281 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
VdrP48281 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
VdrP48281 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
VdrP48281 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
VdrP48281 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
VdrP48281 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
VdrP48281 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
VdrP48281 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
VdrP48281 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
VdrP48281 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
VdrP48281 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
VdrP48281 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
VdrP48281 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
VdrP48281 Gm43339-201ENSMUST00000200032 1606 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
VdrP48281 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
VdrP48281 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
VdrP48281 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
VdrP48281 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
VdrP48281 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
VdrP48281 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
VdrP48281 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms