Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprkP35822 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PtprkP35822 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtprkP35822 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtprkP35822 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtprkP35822 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms