Protein–RNA interactions for Protein: P28312

Defa5, Alpha-defensin 5, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa5P28312 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa5P28312 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa5P28312 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa5P28312 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa5P28312 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa5P28312 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa5P28312 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa5P28312 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa5P28312 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa5P28312 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms