Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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