Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
U2af2P26369 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
U2af2P26369 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
U2af2P26369 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
U2af2P26369 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
U2af2P26369 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
U2af2P26369 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms