Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Ggta1P23336 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ggta1P23336 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ggta1P23336 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
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Ggta1P23336 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ggta1P23336 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ggta1P23336 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ggta1P23336 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ggta1P23336 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ggta1P23336 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Ggta1P23336 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ggta1P23336 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Ggta1P23336 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Ggta1P23336 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ggta1P23336 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ggta1P23336 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ggta1P23336 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ggta1P23336 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ggta1P23336 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ggta1P23336 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Ggta1P23336 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ggta1P23336 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Ggta1P23336 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms