Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms