Protein–RNA interactions for Protein: P0DN34

Ndufb1, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb1P0DN34 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Ctnnd1-223ENSMUST00000111697 5294 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Clec14a-201ENSMUST00000062254 4571 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Kif3c-201ENSMUST00000020999 6791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Chd2-203ENSMUST00000169922 9085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Gramd1b-214ENSMUST00000216821 7445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Tfap2b-201ENSMUST00000027059 5863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Zzef1-208ENSMUST00000207107 11306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 G3bp1-201ENSMUST00000018727 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Inhbe-201ENSMUST00000059718 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Gm42047-202ENSMUST00000212899 4988 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Svil-204ENSMUST00000127297 6243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Acan-201ENSMUST00000032835 7355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Lss-201ENSMUST00000048678 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Spata13-201ENSMUST00000022566 7517 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Lig3-211ENSMUST00000173722 5797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ndufb1P0DN34 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms