Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TtrP07309 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
TtrP07309 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
TtrP07309 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
TtrP07309 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
TtrP07309 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
TtrP07309 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
TtrP07309 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
TtrP07309 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
TtrP07309 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
TtrP07309 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
TtrP07309 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
TtrP07309 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
TtrP07309 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
TtrP07309 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
TtrP07309 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
TtrP07309 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
TtrP07309 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
TtrP07309 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
TtrP07309 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
TtrP07309 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
TtrP07309 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
TtrP07309 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
TtrP07309 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
TtrP07309 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
TtrP07309 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
TtrP07309 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
TtrP07309 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
TtrP07309 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
TtrP07309 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
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TtrP07309 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
TtrP07309 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
TtrP07309 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
TtrP07309 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
TtrP07309 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
TtrP07309 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
TtrP07309 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
TtrP07309 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
TtrP07309 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
TtrP07309 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
TtrP07309 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
TtrP07309 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
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TtrP07309 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
TtrP07309 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
TtrP07309 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
TtrP07309 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
TtrP07309 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
TtrP07309 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
TtrP07309 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
TtrP07309 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
TtrP07309 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
TtrP07309 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
TtrP07309 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
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TtrP07309 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
TtrP07309 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
TtrP07309 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
TtrP07309 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
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TtrP07309 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
TtrP07309 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
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TtrP07309 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
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TtrP07309 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC9.92□□□□□ -0.82
TtrP07309 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
TtrP07309 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
TtrP07309 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
TtrP07309 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
TtrP07309 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
TtrP07309 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
TtrP07309 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
TtrP07309 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
TtrP07309 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
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TtrP07309 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
TtrP07309 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
TtrP07309 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
TtrP07309 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
TtrP07309 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
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