Protein–RNA interactions for Protein: P00848

Mtatp6, ATP synthase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtatp6P00848 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Mtatp6P00848 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mtatp6P00848 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mtatp6P00848 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mtatp6P00848 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mtatp6P00848 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mtatp6P00848 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mtatp6P00848 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mtatp6P00848 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mtatp6P00848 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mtatp6P00848 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mtatp6P00848 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mtatp6P00848 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mtatp6P00848 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mtatp6P00848 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mtatp6P00848 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Mtatp6P00848 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mtatp6P00848 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mtatp6P00848 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mtatp6P00848 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Mtatp6P00848 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mtatp6P00848 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms