Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb2O55203 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ldb2O55203 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms