Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Sp100O35892 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Sp100O35892 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
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Sp100O35892 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sp100O35892 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sp100O35892 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sp100O35892 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sp100O35892 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Sp100O35892 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sp100O35892 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sp100O35892 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sp100O35892 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sp100O35892 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sp100O35892 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sp100O35892 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Sp100O35892 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sp100O35892 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sp100O35892 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Sp100O35892 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sp100O35892 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sp100O35892 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sp100O35892 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Sp100O35892 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sp100O35892 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sp100O35892 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Sp100O35892 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sp100O35892 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Sp100O35892 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Sp100O35892 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sp100O35892 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Sp100O35892 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sp100O35892 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Sp100O35892 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Sp100O35892 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sp100O35892 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sp100O35892 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sp100O35892 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sp100O35892 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Sp100O35892 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sp100O35892 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sp100O35892 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sp100O35892 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sp100O35892 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sp100O35892 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sp100O35892 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sp100O35892 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sp100O35892 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sp100O35892 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sp100O35892 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sp100O35892 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Sp100O35892 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sp100O35892 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sp100O35892 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sp100O35892 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sp100O35892 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sp100O35892 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sp100O35892 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sp100O35892 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sp100O35892 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sp100O35892 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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