Protein–RNA interactions for Protein: O35638

Stag2, Cohesin subunit SA-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag2O35638 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stag2O35638 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stag2O35638 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stag2O35638 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Stag2O35638 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Stag2O35638 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Stag2O35638 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Stag2O35638 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stag2O35638 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Stag2O35638 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stag2O35638 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stag2O35638 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stag2O35638 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stag2O35638 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stag2O35638 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stag2O35638 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stag2O35638 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stag2O35638 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stag2O35638 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stag2O35638 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stag2O35638 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stag2O35638 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stag2O35638 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stag2O35638 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stag2O35638 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stag2O35638 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stag2O35638 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stag2O35638 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stag2O35638 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stag2O35638 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stag2O35638 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stag2O35638 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Stag2O35638 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stag2O35638 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stag2O35638 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stag2O35638 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stag2O35638 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stag2O35638 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stag2O35638 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stag2O35638 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stag2O35638 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stag2O35638 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stag2O35638 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Stag2O35638 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Stag2O35638 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Stag2O35638 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Stag2O35638 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Stag2O35638 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Stag2O35638 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Stag2O35638 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Stag2O35638 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Stag2O35638 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Stag2O35638 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Stag2O35638 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Stag2O35638 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Stag2O35638 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Stag2O35638 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Stag2O35638 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms