Protein–RNA interactions for Protein: O35111

Kcnk3, Potassium channel subfamily K member 3, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnk3O35111 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcnk3O35111 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcnk3O35111 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcnk3O35111 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcnk3O35111 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcnk3O35111 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcnk3O35111 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcnk3O35111 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcnk3O35111 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcnk3O35111 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcnk3O35111 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcnk3O35111 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcnk3O35111 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcnk3O35111 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcnk3O35111 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcnk3O35111 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcnk3O35111 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Kcnk3O35111 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
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Kcnk3O35111 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcnk3O35111 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcnk3O35111 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcnk3O35111 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcnk3O35111 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcnk3O35111 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Kcnk3O35111 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcnk3O35111 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcnk3O35111 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcnk3O35111 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcnk3O35111 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcnk3O35111 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcnk3O35111 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcnk3O35111 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
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Kcnk3O35111 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcnk3O35111 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcnk3O35111 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcnk3O35111 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcnk3O35111 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcnk3O35111 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Kcnk3O35111 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcnk3O35111 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Kcnk3O35111 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Kcnk3O35111 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcnk3O35111 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Kcnk3O35111 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcnk3O35111 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcnk3O35111 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Kcnk3O35111 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcnk3O35111 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcnk3O35111 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcnk3O35111 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcnk3O35111 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcnk3O35111 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcnk3O35111 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcnk3O35111 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcnk3O35111 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcnk3O35111 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcnk3O35111 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcnk3O35111 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcnk3O35111 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcnk3O35111 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Kcnk3O35111 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms