Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U2

Gm3542, Predicted gene 3542, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3542K7N6U2 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3542K7N6U2 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3542K7N6U2 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm3542K7N6U2 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm3542K7N6U2 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm3542K7N6U2 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3542K7N6U2 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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